在Java中，java.security.MessageDigest （rt.jar中）已经定义了 MD5 的计算，所以我们只需要简单地调用即可得到 MD5 的128 位整数。然后将此 128 位计 16 个字节转换成 16 进制表示即可。 

    下面是一个可生成字符串或文件MD5校验码的例子，测试过，可当做工具类直接使用，其中最主要的是getMD5String(String s)和getFileMD5String(File file)两个方法，分别用于生成字符串的md5校验值和生成文件的md5校验值

import Java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.IOException;
import java.nio.MappedByteBuffer;
import java.nio.channels.FileChannel;
import java.security.MessageDigest;
import java.security.NoSuchAlgorithmException;

public class MD5Util {
    /**
    * 默认的密码字符串组合，用来将字节转换成 16 进制表示的字符,apache校验下载的文件的正确性用的就是默认的这个组合 
   */
protected static char hexDigits[] = { '0', '1', '2', '3', '4', '5', '6', '7', '8', '9','a', 'b', 'c', 'd', 'e', 'f' };
protected static MessageDigest messagedigest = null;
static{
   try{
    messagedigest = MessageDigest.getInstance("MD5");
   }catch(NoSuchAlgorithmException nsaex){
    System.err.println(MD5Util.class.getName()+"初始化失败，MessageDigest不支持MD5Util。");
    nsaex.printStackTrace();
   }
}

public static void main(String[] args) throws IOException {
   long begin = System.currentTimeMillis();

   File big = new File("E:/xxxx.rar");

   String md5=getFileMD5String(big);

   long end = System.currentTimeMillis();
   System.out.println("md5:"+md5+" time:"+((end-begin)/1000)+"s");
}

//生成文件的md5码
public static String getFileMD5String(File file) throws IOException {
   FileInputStream in = new FileInputStream(file);
   FileChannel ch = in.getChannel();
   MappedByteBuffer byteBuffer = ch.map(FileChannel.MapMode.READ_ONLY, 0, file.length());
   messagedigest.update(byteBuffer);
   return bufferToHex(messagedigest.digest());
}

//生成字符串的md5码
public static String getMD5String(String s) {
   return getMD5String(s.getBytes());
}

public static String getMD5String(byte[] bytes) {
   messagedigest.update(bytes);
   return bufferToHex(messagedigest.digest());
}

private static String bufferToHex(byte bytes[]) {
   return bufferToHex(bytes, 0, bytes.length);
}

private static String bufferToHex(byte bytes[], int m, int n) {
   StringBuffer stringbuffer = new StringBuffer(2 * n);
   int k = m + n;
   for (int l = m; l < k; l++) {
    appendHexPair(bytes[l], stringbuffer);
   }
   return stringbuffer.toString();
}


private static void appendHexPair(byte bt, StringBuffer stringbuffer) {
   char c0 = hexDigits[(bt & 0xf0) >> 4];
   char c1 = hexDigits[bt & 0xf];
   stringbuffer.append(c0);
   stringbuffer.append(c1);
}

public static boolean checkPassword(String password, String md5PwdStr) {
   String s = getMD5String(password);
   return s.equals(md5PwdStr);
}
}